Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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