Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms