Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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