Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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