Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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