Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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ARHGEF6Q15052 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ARHGEF6Q15052 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms