Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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