Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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