Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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