Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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