Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA5AQ13591 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms