Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms