Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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TUBB3Q13509 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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TUBB3Q13509 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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