Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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