Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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