Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RLFQ13129 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RLFQ13129 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RLFQ13129 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RLFQ13129 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RLFQ13129 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RLFQ13129 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RLFQ13129 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RLFQ13129 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RLFQ13129 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RLFQ13129 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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