Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms