Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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