Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GOLGA3Q08378 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GOLGA3Q08378 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GOLGA3Q08378 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms