Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP1-1Q07627 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms