Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms