Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms