Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POU4F1Q01851 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms