Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLTPP55058 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms