Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP1B3P54709 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP1B3P54709 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms