Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms