Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms