Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms