Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGDP52209 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGDP52209 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGDP52209 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms