Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV1P50549 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms