Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK8P49336 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK8P49336 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms