Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms