Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms