Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms