Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms