Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms