Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP1P30622 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms