Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E1P29083 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms