Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms