Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms