Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MATN1P21941 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MATN1P21941 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MATN1P21941 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MATN1P21941 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MATN1P21941 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MATN1P21941 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MATN1P21941 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms