Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMNB1P20700 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms