Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP4AP20648 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms