Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF3P18847 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF3P18847 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF3P18847 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF3P18847 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF3P18847 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms