Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms