Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2F2P13984 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms