Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
NR2C1P13056 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms