Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms