Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms