Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN2O60636 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN2O60636 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms